北京市丰台区中医医院原名北京市丰台区南苑医院，是1957年5月由北京市政府投资筹建的一所区属非营利性医院，是丰台区区域医疗中心；是丰台区眼病、肢体残疾签定中心；是“北京友谊医疗共同体”成员医院、是“北京中医药大学东方医院”紧密医联体成员医院。2019年8月底，经上级政府批准加挂“丰台区中医医院”牌匾。2021年4月，经上级政府批准正式更名为“北京市丰台区中医医院”。

现配置床位300张；科室包括呼吸科、脾胃病科、心血管内科、脑病科（老年病科）、内分泌科、肿瘤科、肾病科、骨伤科、普外科、肛肠科、泌尿男科、烧伤整形与创面修复科、妇产科、儿科等临床、医技、辅助、职能科室共计49个。同时，三个名老中医传承工作室（刘根尚、郝万山、高彦斌）及三个中医重点专科（烧伤整形与创面修复科、中医肿瘤的绿色诊治、流行病与传染病的中医药防治）成为医院特色；中医内病外治、中医绿色肿瘤成为医院建设品牌。

2019年，我院与安贞医院心血管内科专家团队建立合作，成立“南城心血管疑难危重疾病诊治中心”、同年又与积水潭医院、协和医院骨科专家建立合作，成立“积水潭医院南城关节保护中心”、“协和医院南城脊柱保护中心”。全院各临床科室均聘请有三级医院的专家极大方便了患者就医需要。

2016年底，我院发展特色医疗模式，率先应用“整合医学”诊疗模式，借助中医体质辨识-心理检测平台筛查，开展心理门诊、中医会诊、沙盘治疗、主动对话治疗等特色治疗方法，得到辖区百姓好评；
2017年5月4日中国红十字基金会指定南苑医院为“徐荣祥再生生命公益基金定点医院”；
2017年6月获得“澳门城市大学应用心理学实践教学基地”称号；
2017年12月16日中国医师协会正式为我院授牌“整合医学研究示范医院”，标志着北京市首家整合医学研究示范医院正式成立。
2018年7月获得“中国中西医结合学会烧伤专业委员会烧伤创疡临床（培训）基地”称号。